98年全國大專院校運動會，自5月2日起至5月6日止，展開一連5天的精彩競技！由國立臺灣師範大學承辦，共舉辦12個種類的運動項目。本校今年參加田徑、游泳、網球、羽球、桌球、柔道、跆拳道、擊劍、射箭、體操及空手道等11個項目，各項目的成績表現相當亮眼，一共獲得40面金牌、27面銀牌、19面銅牌，總計86面獎牌數。參賽的162所大專校院中，在許多學校一金難求的情況之下，本校的金牌數量，僅次於國立臺灣師範大學位居第二，突出的成績表現，超越也震撼了許多體育科系的專業院校。
在團體錦標方面，榮獲冠軍的運動項目，分別有游泳項目的公開男生組及一般女生組、網球項目的一般男生組、射箭項目的一般女生組和擊劍項目的一般男生組(鈍劍)。團體錦標所代表的是學校在該項運動整體推展的結果與展現，其價值超越了個人金牌所帶來的意義。 值得一提的是，在今年甫獲選為本校重點發展運動代表隊的游泳隊，是本校傳統特色的運動項目之ㄧ，在大運會的大金庫游泳項目中，囊括24面金牌、20面銀牌、7面銅牌，為隊史上最多金的一屆！除此之外，一般組及公開組聯手打破10項大會紀錄，使臺大游泳隊在比賽期間成為最受矚目的明星隊伍！其中，隊上的3位『研究生』選手：公開男生組陳卓逸、一般女生組高致潔與邱亭瑋，兼顧學業與訓練，在全大運的優異表現，給了大學部的學弟妹最好的示範。
同樣為本校重點發展運動代表隊的田徑隊，在今年也拿下4面金牌、3面銀牌、3面銅牌的佳績，一般男、女生組的團體總成績均獲得季軍。在本校廣受師生喜愛的傳統運動項目－網球，一直以來在全大運中名聲響亮，屢屢獲得佳績，今年在一般男生組團體賽中，再次奪冠，創下四連霸的紀錄，而且在強敵環伺的公開女生組團體賽中，亦突破重圍，獲得季軍的殊榮，值得喝采。在參賽隊數六、七十隊的團隊運動項目中，脫穎而出並不容易，尤其是桌球、羽球項目，本校過去在這兩項運動項目，亦維持優良傳統，今年雖沒有獲得冠軍，但在一般男子組羽球團體和一般女子組桌球團體，也有獲得季軍的成績，值得鼓勵。
另一個備受矚目的項目－射箭，維持過去的傳統，在射箭場上屢獲佳績，96年大運會的一般女生組團體冠軍，97年在四強戰以一分之差敗給長庚大學，今年捲土重來，在女子團體對抗賽中，文采薇、唐鈺涵、吳得心三位同學，聯手以總分315分打破大會紀錄的成績，為本校精采的射下金牌。除了在競賽成績亮眼之外，在本屆全大運的聖火傳遞活動中，本校很榮幸擔任聖火傳遞的第一站！在5月1日於本校的校門口，由李嗣涔校長親自率領本校大運代表隊所有選手迎接全大運聖火隊，當日的聖火傳遞儀式莊嚴而隆重。首先，由李校長接下全大運的主火，再將主火交接本校聖火隊隊員。本校聖火隊由主火手田徑隊隊長林哲宇、副火手游泳隊邱亭瑋、桌球隊林紘玄、羽球隊周柏君、網球隊戴幼琳、柔道隊陳淑芬及跆拳道隊王士杰等6位同學擔任。當日李校長自大運會聖火隊接下主火的那一刻，也象徵著運動精神的傳承與生生不息，也將今年全大運的主題『卓越競技 樂活運動』的精神承接下去。
本屆全大運圓滿結束，本校也將持續朝下一屆的全大運努力邁進，期待明年能夠更上層樓，再創佳績！