98學年度新生入學典禮已於9月13日（星期日）於舊體育館隆重舉行，今年大學部及研究所新生共有9,328人。李校長在典禮中期勉臺大新鮮人，把握黃金歲月從根本做起，砥礪自己，摸索進入臺大的「傳統」，終身做一個真正的「臺大人」。今年新生入學輔導活動於9月7日至9月12日在校園舉辦兩梯次的「新生學習入門書院」，新生入門書院係擷取新生定向輔導的概念，由學務處、教務處與總務處共同推動，甄選臺大校內社團經驗豐富的優秀高年級學生擔任書院隊輔，帶領新生參與各式課程和討論，除了立即解答新生疑惑，消除焦慮之外，還可以進一步地與新生分享對於課程及未來規劃的心得，了解臺大核心價值及臺大人精神，幫助新生適應大學生活，站穩椰林大道上的第一步。
活動課程除了新鮮人一定要知道的課程規劃與選課方法、大學生的讀書方法、智慧財產權與性別平等知識外，還有活潑的校園導覽和人際溝通活動。為了提升新生的學習品質，校方投入所有的學習資源，大部份的課為35人的小班；4,300位新生打破院系界線，分成120個小隊，在活動參與中，拓展多元的人際關係。
本學年度的新生學習入門書院活動為第二次辦理，值得一提的是，為了落實臺灣大學「敦品勵學，愛國愛人」的校訓，活動期間特別設計「服務學習」課程，邀請具豐富實際服務經驗的社團，包含國際志工社、漁村服務社、慈青社、傳統醫學社、種子教育社、新心社、陽光椰子社、自然保育社等社團為初入臺大的新鮮人進行分享，做為學弟妹的楷模。詳網頁：http://140.112.162.58/。