在業務推動方面，發展初期「人文社會高等研究院」延續過去的「卓越計畫與卓越延續計畫」，結合人文社會科學領域中，具有卓越學術研究潛力之研究團隊，以「東亞經典與文化研究計畫」、「東亞民主研究計畫」，以及「全球化研究計畫」、「東亞法制之形成」等四項大型創始計畫為發展重心，執行整合型研究計畫。
為落實學術國際化，「人文社會高等研究院」將邀請國內外學者蒞院訪問、發表系列演講或駐點研究，結合國際學術資源，使本校人文社會相關領域之教授與研究生與世界相關領域之重量級學者建立良好互動關係，並建立跨校、跨國之卓越研究團隊。目前「人文社會高等研究院」合作交流的對象，包括美國普林斯頓高等研究院 (Institute for Advanced Study, Princeton)、德國埃森人文高等研究院(Institute for Advanced Study in the Humanities, Essen)、南京大學人文社會科學高級研究院等。同時，亦規劃與國外著名之學術出版社合作，建立共同出版之機制，將研發成果、講座內容與演講等，出版學術刊物並於國際發行。藉由與世界著名之大學高等研究院的互動交流，「人文社會高等研究院」將使臺灣大學人文社會領域之學術研究與世界接軌，往全球頂尖大學之目標更進一步。
針對目前在各人文社會領域院、系、所中，凡非學術研究主流或重點，但在整個人文社會學術領域內具有研究價值之跨科際整合研究，「人文社會高等研究院」將培養、發掘此類卓越研究團隊，成為跨科際研究計畫的整合平臺，並與具備學術專業的各院、系、所密切合作，以提高臺大學術資源整合的效益，並為人文社會學門開創更豐富的多元性！
